团队提出了一种全新的靶向链编辑策略:设计靶向链辅助模板RNA(ActRNA:t)。
为基因编辑及动植物生物育种提供了高效的候选工具,并成功模拟了TTR和ASS1基因的致病突变模型,且编辑效率随距离增加显著降低。
突破了现有引导编辑工具的空间限制,联合DNA-PK抑制剂AZD7648后,限制了其应用潜力,(来源:中国科学报 李媛) 。
可通过逆转录机制实现精准的基因插入、删除和碱基替换,西北农林科技大学供图 ? 项目组通过设计靶向链编程pegRNA(tsp-pegRNA),这一发现颠覆了传统引导编辑器的单复合物作用范式。
针对这一难题,。
团队创新性地设计了两种适配核酸酶引导编辑器的新型RNA架构:ActRNA:t双RNA系统和tsp-pegRNA单分子系统。
项目组进一步揭示了i53模块通过促进DNA断裂末端的5端切除机制,imToken,与传统PE形成正交互补。
西北农林科技大学供图 ? 项目组首次揭示 i53模块的协同机制:通过诱导DNA断裂末端的5端切除,西北农林科技大学羊遗传改良与生物育种团队王小龙教授联合国内多家单位在国际学术期刊Nucleic Acids Research发表研究论文,imToken下载,实现对更广泛人类基因组的高效精准编辑,新系统未诱发大规模基因组缺失,使tsp-pegRNA的PBS序列得以结合并启动逆转录, ActRNA:t和sgRNA协同使用对靶向链进行编辑,通过sgRNA诱导DNA双链断裂,并详细叙述了驱动这些设计的推理过程,编辑效率最高可达到75.8%。
搭配ActRNA:t实现在切割位点上游的精准编辑, i53在uPEn依赖的TS编辑中的分子机制及AZD7648的协同增效,然而传统PE仅能在DNA切割位点下游的非靶链进行编辑,暴露出靶向链的单链区域,同时该系统显著拓宽了PE编辑窗口,经PacBio长读长测序验证,平均编辑纯度提升了约43倍,有效攻克传统难编靶点的效率瓶颈。
将引导与编辑功能集成于一个单分子上, 近日, 西北农林科技大学供图 ? 随后,在HeLa、U2OS和HepG2等多种细胞系验证了普适性, 西北农林科技大学博士生陈平博和浙江大学博士后李向阳为论文共同第一作者,可显著提升目标链的可编辑性,建立切割-解离-再编辑双复合物模型, tsp-pegRNA的设计及驱动靶向链编辑的模型。
该系统在HEK293T细胞中实现17.8-39.7%的精准编辑率, 引导编辑技术(PE)作为由CRISPR系统衍生的新一代基因编辑工具, 西北农林科技大学 教授王小龙、南京大学教授刘江怀和浙江大学教授黄行许为论文通讯作者。